A iniciação científica é um programa focado em alunos de gradução que visa o desenvolvimento de um projeto de pesquisa em qualquer área do conhecimento com a orientação de cientistas mais experientes. Dessa forma, seu objetivo principal é ensinar ao estudante o método científico e permitir que ele se envolva em projetos de pesquisa eContinuar lendo “Iniciação científica: o que é e como aproveitar ao máximo”
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Bioinformática na agricultura
A disponibilidade de enorme volume de dados de sequenciamento de nova geração (NGS do inglês Next Generation Sequencing) de hospedeiros e patógenos em domínio público tem no trazido importantes oportunidades para melhor compreensão das doenças de plantas de forma sistêmica. Com os dados produzidos, é possível identificar e caracterizar elementos funcionais no nível gênico comContinuar lendo “Bioinformática na agricultura”
O que são mapas de distância?
Um mapa de distância é uma representação bidimensional (matriz) da estrutura tridimensional de uma proteína. Eles são matrizes quadradas onde o eixo-x representa a sequência de aminoácidos de uma proteína e o eixo-y representa a mesma sequência. Dessa forma, cada célula (x,y) contém um valor real que é a distância euclideana entre o resíduo xContinuar lendo “O que são mapas de distância?”
Você se interessa por divulgação científica?
Já contamos algumas vezes a história de como iniciamos este projeto de extensão em divulgação científica algumas vezes. A ideia surgiu há mais de 5 anos de forma bem despretenciosa e experimental. Simplesmente notamos que havia uma lacuna importante de conteúdos de BIoinformática, especialmente em língua portuguesa no YouTube. Na verdade, alguns anos depois aindaContinuar lendo “Você se interessa por divulgação científica?”
Nossa experiência com o Ensino de Bioinformática a Distância
Desde a criação do projeto de extensão universitária OnlineBioinfo em 2018, uma de nossas missões era atrair talentos para Bioinformática. Nessa empreitada, um dos desafios é apoiar em uma das grandes dificuldades de quem inicia na Bioinformática. Como aprender a área complementar á sua área de formação? Quem é formado em computação e áreas afinsContinuar lendo “Nossa experiência com o Ensino de Bioinformática a Distância”
O que acontece quando uma proteína sofre uma mutação?
Mutações não sinônimas podem gerar substituições em aminoácidos em proteínas. Mutações podem gerar inúmeros efeitos em proteínas. Esses efeitos podem ser desde benéficos a deletérios. Entre os efeitos benéficos podemos citar a aquisição ou aperfeiçoamento de uma função em uma enzima de interesse industrial. Entre os deletérios, podemos citar doenças causadas pelo mau funcionamento deContinuar lendo “O que acontece quando uma proteína sofre uma mutação?”
O AlphaFold e o desenvolvimento de vacinas
Desenvolvimento de vacinas assistido pela estrutura de proteínas Em um vídeo anterior no canal do YouTube do OnlineBioinfo, falamos sobre o desenvolvimento de vacinas e a Bioinformática. Nesse video, focamos no uso de técnicas de aprendizado de máquina para a identificação de epitopos, que são pequenas porções antigênicas do patógeno. Ou seja, trechos das proteínasContinuar lendo “O AlphaFold e o desenvolvimento de vacinas”
Semanas 6-7 – Eu tive que parar
O hábito da leitura diária estava caminhando bem quando as costumeiras tarefas urgentes chegaram em peso. No início, consegui levar as coisas e manter as leituras. Depois, eu tive que parar. As bancas apertaram, depois uma submissão para um grande edital e, por fim, para completar, o fechamento do semestre. Muitos trabalhos para corrigir, notasContinuar lendo “Semanas 6-7 – Eu tive que parar”
Sítio de ligação e sítio ativo
Proteínas globulares desempenham funções bastante diversificadas e sofisticadas como catálise de reações químicas, transporte de moléculas, sinalização, defesa, regulação. Para tal, uma das funções necessárias é a habilidade de formar sítios de ligação e sítios ativos (Kessel e Ben-Tal, 2018). Essa habilidade consiste em se enovelar tomando uma estrutura tridimensional globular que traz para pertoContinuar lendo “Sítio de ligação e sítio ativo”
Semana 5 – Lendo outros tipos de trabalhos científicos
Minha quinta semana não foi muito produtiva em termos de leituras de artigos. Entretanto isso aconteceu pois tive uma grande carga de compromissos relativos á avaliação de trabalhos de pós-graduação. Como estive em duas bancas de qualificação, dediquei um tempo considerável avaliando esses trabalhos. É bem mais complicado ler um trabalho científico para avaliação doContinuar lendo “Semana 5 – Lendo outros tipos de trabalhos científicos”
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