Um mapa de distância é uma representação bidimensional (matriz) da estrutura tridimensional de uma proteína. Eles são matrizes quadradas onde o eixo-x representa a sequência de aminoácidos de uma proteína e o eixo-y representa a mesma sequência. Dessa forma, cada célula (x,y) contém um valor real que é a distância euclideana entre o resíduo xContinuar lendo “O que são mapas de distância?”
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O que acontece quando uma proteína sofre uma mutação?
Mutações não sinônimas podem gerar substituições em aminoácidos em proteínas. Mutações podem gerar inúmeros efeitos em proteínas. Esses efeitos podem ser desde benéficos a deletérios. Entre os efeitos benéficos podemos citar a aquisição ou aperfeiçoamento de uma função em uma enzima de interesse industrial. Entre os deletérios, podemos citar doenças causadas pelo mau funcionamento deContinuar lendo “O que acontece quando uma proteína sofre uma mutação?”
Como identificar sítios de ligação em proteínas?
Sítios de ligação são conjuntos de resíduos de aminoácidos que estão em bolsões de ligação de moléculas que interagem com proteínas. Esses ligantes podem ser pequenas moléculas, peptídeos ou outras proteínas. Os bolsões são frestas muitas vezes volumosas que recebem os ligantes na superfície das proteínas. Veja um exemplo de uma molécula de aspirina ligadaContinuar lendo “Como identificar sítios de ligação em proteínas?”
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